本发明公开了一种存量垃圾原位资源化处理方法和系统，系统包括：将垃圾暂存区内的垃圾运送至板式给料机；板式给料机依次连接第一破碎装置和滚筒筛；滚筒筛的第一出口连接风选装置；风选装置的第一出口连接第一破碎装置，第二出口依次连接第二磁选装置、液体式滚筒筛和脱水装置；脱水装置的出口连接好氧生物干化反应器的第一入口；滚筒筛的第二出口连接第一磁选装置和弛张筛；其中，弛张筛的出口连接好氧生物干化反应器的第二入口；好氧生物干化反应器的出口连接有机肥料压缩打包装置；好氧生物干化反应器还连接有渗滤液处理系统和除臭系统；且垃圾暂存区还与渗滤液处理系统相连接，既能够杜绝二次污染的产生，又可实现存量垃圾高度资源化利用。