本发明公开了水体CDOM荧光及非荧光物质分布遥感探测方法，在目标流域布设调查点位，利用无人机高光谱探测器探测CDOM和荧光激光雷达探测FDOM；选取部分调查点位实测其CDOM和FDOM浓度；结合高光谱探测器探测的CDOM与实测CDOM浓度，建立CDOM浓度反演模型；通过反演模型结合调查点位高光谱数据，获得所有调查点位CDOM数据；结合LIF技术探测的荧光数据与实测FDOM浓度数据，建立FDOM浓度反演模型；通过反演模型结合调查点位荧光光谱数据，获得所有调查点位FDOM数据；结合CDOM浓度数据和FDOM浓度数据，得到NFDOM浓度；通过对数据进行分析，模拟FDOM和NFDDOM的浓度分布情况。