一种降低土壤镉含量的复合钝化剂的制备方法，主要包含以下步骤：步骤 1：枯草芽孢杆菌依次经活化、扩培，获得枯草芽孢杆菌的菌悬液；步骤 2：所得枯草芽孢杆菌的菌悬液浓度为 108-109 cfu/mL，菌悬液与生物炭以体积：质量为2.5:1 混合，振荡培养 45-55 h，得到枯草芽孢杆菌 - 生物炭复合体；步骤 3：将枯草芽孢杆菌 - 生物炭复合体与 3％海藻酸钠溶液等体积混合，形成复合凝胶剂，用注射器将其逐滴滴入等体积的 1％氯化钙溶液中，形成复合体微球，再静止 24 h，得到复合钝化剂。还提供了复合钝化剂在油菜种植应用，经测定降低土壤中镉 80.92％以及油菜中镉 55.10％，同时生物含量提高 75.86％。