本发明公开了一种利用 CRISPR-Cas9 系统敲除甘蓝型油菜 BnMAX1 基因的方法及应用，设计了两种特异性靶向甘蓝型油菜 BnMAX1 基因的 sgRNA 并制成 oligo 二聚体，与 Cas9 载体连接，通过农杆菌介导的遗传转化技术导入到甘蓝型油菜下胚轴愈伤并再生成苗，Cas9 核酸酶在 sgRNA 的引导下，剪切目标序列，每条 sgRNA 都能通过 CRISPR-Cas9 系统介导 A 和 C 基因组上 BnMAX1基因的剪切，达到基因敲除的目的。经过表型鉴定，发现纯合突变株系增加了分枝数、单株角果数，降低植株高度，同时也增加了产量。